Pada tahun 298 dari era para dewa, gadis sekolah dasar Washio Sumi, Nogi Sonoko, dan Minowa Gin ditugasi misi penting. Mereka menjadi pahlawan dan melawan Vertex, musuh misterius yang menyerang Shinju-sama, pohon dewa yang melindungi Shikoku, satu-satunya wilayah di dunia yang masih bisa dihuni. Apa yang tidak mereka ketahui, adalah bahwa pertarungan ini akan merugikan mereka lebih dari yang pernah mereka bayangkan.